近年来频频曝出的瘦肉精、毒花椒、墨汁粉条、毒生姜、三聚氰胺、皮革阿胶等等早已把国人练就一身百毒不侵。高频曝光的食品安全问题，催生了人们“追根溯源”的需求。但是在推广试点的过程中，不少企业仍然处于冷淡状态，漠不关心，而终端消费者却只能敢怒而不敢言。
企业不愿在溯源体系建设上投入过多成本
产品溯源是一门技术活，涉及产品生产、加工、流通和消费等环节。因此企业建立溯源体系前期建设需要投入大量的精力、人力、和资金。企业产品溯源体系的建成，是一个春天播种，秋天收获的过程，而大多数企业只狭隘于眼下的投入大、维护多、产出少、软硬件成本略高的想法，不注重品牌形象和品牌信誉细水长流的建立。
溯源系统第三方平台水平参差不齐
目前市场上做防伪溯源的第三方平台非常多，有些是真正的拥有自主知识产权的平台，有些甚至没有自己的核心竞争力。因此建议企业一定要选择具有专业性、权威性、国家公信力的第三方溯源技术服务提供商，借助平台建立溯源体系，即可将成本控制在可承范围，又能通过溯源成为企业长期效益的不竭之府。
消费者端，用户习惯没培养好
一方面是食品安全溯源理念在消费者中的普及度和接受度还有待提高；另一方面是市面上的产品并没有“扫码查溯源”的功能。对此，政府部门和相关单位应增加对食品安全的宣传，使消费者对拥有可追溯系统的食品具有更强的消费意愿。只有社会各界都参与进去，食品溯源系统体系的建立才能真正实现预期的效果。
解决溯源需求与企业溯源技术存在的问题以是重中之重，溯源不仅可以保障消费者的知情权，而且最重要的是能形成召回制度，一旦发生问题，精准找到问题产品批次，精确到每件产品，最大程度保障消费者安全，降低社会伤害。